Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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STX4Q12846 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
STX4Q12846 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
STX4Q12846 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
STX4Q12846 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
STX4Q12846 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
STX4Q12846 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
STX4Q12846 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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STX4Q12846 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
STX4Q12846 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
STX4Q12846 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
STX4Q12846 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
STX4Q12846 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
STX4Q12846 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
STX4Q12846 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
STX4Q12846 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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STX4Q12846 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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STX4Q12846 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
STX4Q12846 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
STX4Q12846 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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STX4Q12846 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
STX4Q12846 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
STX4Q12846 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
STX4Q12846 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
STX4Q12846 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
STX4Q12846 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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STX4Q12846 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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STX4Q12846 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
STX4Q12846 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
STX4Q12846 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
STX4Q12846 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
STX4Q12846 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
STX4Q12846 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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STX4Q12846 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
STX4Q12846 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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STX4Q12846 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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STX4Q12846 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
STX4Q12846 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
STX4Q12846 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
STX4Q12846 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
STX4Q12846 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
STX4Q12846 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
STX4Q12846 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
STX4Q12846 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
STX4Q12846 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
STX4Q12846 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
STX4Q12846 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
STX4Q12846 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
STX4Q12846 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
STX4Q12846 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
STX4Q12846 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
STX4Q12846 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
STX4Q12846 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
STX4Q12846 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
STX4Q12846 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
STX4Q12846 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
STX4Q12846 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
STX4Q12846 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
STX4Q12846 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
STX4Q12846 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
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