Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms