Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms