Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 LINC00888-202ENST00000471496 1490 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 LINC02139-201ENST00000612023 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 CFTRP3-201ENST00000376400 212 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AC013402.3-201ENST00000438566 451 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 LINC01578-206ENST00000555520 977 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AC004918.3-201ENST00000602609 925 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms