Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms