Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OC90Q02509 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OC90Q02509 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OC90Q02509 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OC90Q02509 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OC90Q02509 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OC90Q02509 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OC90Q02509 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OC90Q02509 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OC90Q02509 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OC90Q02509 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OC90Q02509 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OC90Q02509 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OC90Q02509 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OC90Q02509 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OC90Q02509 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OC90Q02509 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
OC90Q02509 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OC90Q02509 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OC90Q02509 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OC90Q02509 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OC90Q02509 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OC90Q02509 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OC90Q02509 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OC90Q02509 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
OC90Q02509 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
OC90Q02509 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OC90Q02509 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OC90Q02509 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OC90Q02509 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OC90Q02509 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OC90Q02509 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OC90Q02509 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OC90Q02509 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OC90Q02509 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OC90Q02509 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OC90Q02509 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OC90Q02509 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OC90Q02509 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OC90Q02509 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OC90Q02509 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
OC90Q02509 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OC90Q02509 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
OC90Q02509 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
OC90Q02509 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OC90Q02509 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OC90Q02509 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OC90Q02509 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OC90Q02509 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
OC90Q02509 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OC90Q02509 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OC90Q02509 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OC90Q02509 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OC90Q02509 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OC90Q02509 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OC90Q02509 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OC90Q02509 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OC90Q02509 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OC90Q02509 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OC90Q02509 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OC90Q02509 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OC90Q02509 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OC90Q02509 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OC90Q02509 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OC90Q02509 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OC90Q02509 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OC90Q02509 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OC90Q02509 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OC90Q02509 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OC90Q02509 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OC90Q02509 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OC90Q02509 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OC90Q02509 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OC90Q02509 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OC90Q02509 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OC90Q02509 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OC90Q02509 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OC90Q02509 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OC90Q02509 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OC90Q02509 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OC90Q02509 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OC90Q02509 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OC90Q02509 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OC90Q02509 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OC90Q02509 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OC90Q02509 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OC90Q02509 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OC90Q02509 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OC90Q02509 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OC90Q02509 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OC90Q02509 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OC90Q02509 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OC90Q02509 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OC90Q02509 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OC90Q02509 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OC90Q02509 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OC90Q02509 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OC90Q02509 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OC90Q02509 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OC90Q02509 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms