Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XPCQ01831 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XPCQ01831 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XPCQ01831 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XPCQ01831 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XPCQ01831 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XPCQ01831 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XPCQ01831 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XPCQ01831 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XPCQ01831 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XPCQ01831 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XPCQ01831 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XPCQ01831 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XPCQ01831 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XPCQ01831 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XPCQ01831 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XPCQ01831 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XPCQ01831 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XPCQ01831 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XPCQ01831 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XPCQ01831 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XPCQ01831 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XPCQ01831 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
XPCQ01831 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XPCQ01831 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XPCQ01831 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XPCQ01831 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XPCQ01831 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
XPCQ01831 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XPCQ01831 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
XPCQ01831 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XPCQ01831 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XPCQ01831 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XPCQ01831 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XPCQ01831 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XPCQ01831 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XPCQ01831 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XPCQ01831 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XPCQ01831 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XPCQ01831 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
XPCQ01831 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XPCQ01831 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XPCQ01831 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XPCQ01831 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XPCQ01831 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XPCQ01831 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XPCQ01831 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XPCQ01831 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XPCQ01831 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XPCQ01831 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XPCQ01831 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XPCQ01831 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
XPCQ01831 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XPCQ01831 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XPCQ01831 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
XPCQ01831 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XPCQ01831 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XPCQ01831 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XPCQ01831 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XPCQ01831 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XPCQ01831 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XPCQ01831 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XPCQ01831 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XPCQ01831 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XPCQ01831 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
XPCQ01831 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XPCQ01831 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XPCQ01831 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XPCQ01831 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XPCQ01831 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XPCQ01831 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XPCQ01831 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XPCQ01831 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPCQ01831 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPCQ01831 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPCQ01831 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPCQ01831 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPCQ01831 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPCQ01831 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPCQ01831 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPCQ01831 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
XPCQ01831 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPCQ01831 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPCQ01831 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPCQ01831 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPCQ01831 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPCQ01831 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPCQ01831 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
XPCQ01831 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPCQ01831 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPCQ01831 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPCQ01831 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPCQ01831 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPCQ01831 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPCQ01831 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
XPCQ01831 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPCQ01831 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPCQ01831 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPCQ01831 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPCQ01831 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms