Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
MC1RQ01726 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms