Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms