Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms