Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLK1P49759 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLK1P49759 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLK1P49759 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLK1P49759 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLK1P49759 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLK1P49759 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLK1P49759 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLK1P49759 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLK1P49759 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLK1P49759 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLK1P49759 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLK1P49759 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLK1P49759 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLK1P49759 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLK1P49759 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLK1P49759 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLK1P49759 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLK1P49759 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLK1P49759 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLK1P49759 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLK1P49759 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLK1P49759 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLK1P49759 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLK1P49759 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLK1P49759 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLK1P49759 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLK1P49759 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLK1P49759 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLK1P49759 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLK1P49759 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLK1P49759 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLK1P49759 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLK1P49759 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLK1P49759 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLK1P49759 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLK1P49759 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLK1P49759 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLK1P49759 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLK1P49759 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLK1P49759 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLK1P49759 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLK1P49759 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLK1P49759 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLK1P49759 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLK1P49759 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLK1P49759 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLK1P49759 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLK1P49759 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLK1P49759 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLK1P49759 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLK1P49759 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLK1P49759 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLK1P49759 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLK1P49759 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLK1P49759 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLK1P49759 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLK1P49759 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLK1P49759 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLK1P49759 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLK1P49759 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLK1P49759 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLK1P49759 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLK1P49759 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLK1P49759 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLK1P49759 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLK1P49759 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLK1P49759 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLK1P49759 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLK1P49759 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLK1P49759 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLK1P49759 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLK1P49759 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLK1P49759 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLK1P49759 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLK1P49759 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLK1P49759 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLK1P49759 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLK1P49759 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLK1P49759 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLK1P49759 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLK1P49759 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLK1P49759 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLK1P49759 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLK1P49759 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLK1P49759 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLK1P49759 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLK1P49759 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLK1P49759 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLK1P49759 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLK1P49759 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLK1P49759 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLK1P49759 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLK1P49759 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLK1P49759 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLK1P49759 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLK1P49759 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLK1P49759 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLK1P49759 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLK1P49759 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms