Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTPAP49638 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTPAP49638 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTPAP49638 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTPAP49638 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTPAP49638 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTPAP49638 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TTPAP49638 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTPAP49638 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTPAP49638 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTPAP49638 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTPAP49638 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTPAP49638 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TTPAP49638 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTPAP49638 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTPAP49638 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTPAP49638 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTPAP49638 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTPAP49638 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTPAP49638 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTPAP49638 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTPAP49638 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTPAP49638 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTPAP49638 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TTPAP49638 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TTPAP49638 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTPAP49638 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TTPAP49638 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTPAP49638 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTPAP49638 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTPAP49638 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTPAP49638 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TTPAP49638 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TTPAP49638 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TTPAP49638 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTPAP49638 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTPAP49638 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTPAP49638 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTPAP49638 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTPAP49638 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTPAP49638 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTPAP49638 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTPAP49638 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTPAP49638 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTPAP49638 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTPAP49638 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TTPAP49638 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTPAP49638 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTPAP49638 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTPAP49638 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTPAP49638 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTPAP49638 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTPAP49638 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTPAP49638 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTPAP49638 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTPAP49638 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTPAP49638 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTPAP49638 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTPAP49638 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTPAP49638 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTPAP49638 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTPAP49638 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTPAP49638 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTPAP49638 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTPAP49638 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTPAP49638 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTPAP49638 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTPAP49638 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTPAP49638 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TTPAP49638 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTPAP49638 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTPAP49638 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTPAP49638 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTPAP49638 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTPAP49638 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TTPAP49638 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTPAP49638 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TTPAP49638 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTPAP49638 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTPAP49638 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTPAP49638 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTPAP49638 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTPAP49638 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTPAP49638 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTPAP49638 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTPAP49638 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTPAP49638 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TTPAP49638 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTPAP49638 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTPAP49638 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTPAP49638 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTPAP49638 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTPAP49638 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTPAP49638 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTPAP49638 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTPAP49638 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTPAP49638 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTPAP49638 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTPAP49638 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTPAP49638 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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