Protein–RNA interactions for Protein: P43234

CTSO, Cathepsin O, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSOP43234 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTSOP43234 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTSOP43234 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTSOP43234 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTSOP43234 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTSOP43234 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTSOP43234 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSOP43234 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSOP43234 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSOP43234 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSOP43234 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSOP43234 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSOP43234 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSOP43234 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSOP43234 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSOP43234 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSOP43234 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSOP43234 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSOP43234 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSOP43234 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSOP43234 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSOP43234 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSOP43234 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSOP43234 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSOP43234 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSOP43234 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSOP43234 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSOP43234 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSOP43234 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSOP43234 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSOP43234 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSOP43234 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSOP43234 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSOP43234 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSOP43234 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSOP43234 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSOP43234 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSOP43234 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSOP43234 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSOP43234 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSOP43234 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSOP43234 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSOP43234 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSOP43234 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSOP43234 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSOP43234 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSOP43234 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSOP43234 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSOP43234 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSOP43234 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSOP43234 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSOP43234 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSOP43234 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSOP43234 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSOP43234 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSOP43234 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSOP43234 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSOP43234 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSOP43234 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSOP43234 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSOP43234 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSOP43234 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSOP43234 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSOP43234 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSOP43234 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSOP43234 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSOP43234 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSOP43234 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSOP43234 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSOP43234 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSOP43234 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSOP43234 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSOP43234 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSOP43234 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSOP43234 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSOP43234 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSOP43234 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSOP43234 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSOP43234 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSOP43234 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSOP43234 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSOP43234 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSOP43234 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSOP43234 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSOP43234 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSOP43234 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSOP43234 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSOP43234 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSOP43234 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSOP43234 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSOP43234 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSOP43234 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSOP43234 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSOP43234 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSOP43234 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSOP43234 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSOP43234 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSOP43234 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSOP43234 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSOP43234 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms