Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms