Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms