Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SFNP31947 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SFNP31947 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFNP31947 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFNP31947 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFNP31947 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFNP31947 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFNP31947 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SFNP31947 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SFNP31947 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SFNP31947 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFNP31947 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFNP31947 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SFNP31947 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SFNP31947 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFNP31947 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFNP31947 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFNP31947 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFNP31947 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFNP31947 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFNP31947 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFNP31947 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFNP31947 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFNP31947 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFNP31947 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFNP31947 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFNP31947 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFNP31947 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFNP31947 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFNP31947 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFNP31947 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFNP31947 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFNP31947 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFNP31947 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFNP31947 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFNP31947 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFNP31947 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFNP31947 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFNP31947 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SFNP31947 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFNP31947 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFNP31947 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFNP31947 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFNP31947 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFNP31947 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFNP31947 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFNP31947 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFNP31947 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFNP31947 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFNP31947 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFNP31947 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFNP31947 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFNP31947 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFNP31947 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFNP31947 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFNP31947 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFNP31947 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFNP31947 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SFNP31947 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFNP31947 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFNP31947 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFNP31947 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFNP31947 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFNP31947 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFNP31947 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFNP31947 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFNP31947 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFNP31947 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFNP31947 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFNP31947 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFNP31947 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFNP31947 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFNP31947 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFNP31947 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFNP31947 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFNP31947 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFNP31947 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFNP31947 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFNP31947 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFNP31947 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFNP31947 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFNP31947 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFNP31947 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFNP31947 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFNP31947 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SFNP31947 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFNP31947 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFNP31947 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SFNP31947 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFNP31947 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFNP31947 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFNP31947 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFNP31947 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFNP31947 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFNP31947 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFNP31947 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFNP31947 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFNP31947 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFNP31947 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFNP31947 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms