Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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