Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA3P25788 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms