Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms