Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms