Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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