Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms