Protein–RNA interactions for Protein: P23193

TCEA1, Transcription elongation factor A protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1P23193 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms