Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALB2P22676 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALB2P22676 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALB2P22676 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CALB2P22676 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALB2P22676 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALB2P22676 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALB2P22676 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALB2P22676 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALB2P22676 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CALB2P22676 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALB2P22676 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALB2P22676 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALB2P22676 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALB2P22676 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALB2P22676 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALB2P22676 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALB2P22676 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALB2P22676 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALB2P22676 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALB2P22676 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALB2P22676 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CALB2P22676 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALB2P22676 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALB2P22676 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALB2P22676 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALB2P22676 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CALB2P22676 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALB2P22676 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALB2P22676 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALB2P22676 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALB2P22676 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALB2P22676 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALB2P22676 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALB2P22676 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALB2P22676 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALB2P22676 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALB2P22676 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALB2P22676 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALB2P22676 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALB2P22676 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALB2P22676 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALB2P22676 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALB2P22676 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALB2P22676 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALB2P22676 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALB2P22676 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALB2P22676 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALB2P22676 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALB2P22676 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALB2P22676 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALB2P22676 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALB2P22676 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALB2P22676 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALB2P22676 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALB2P22676 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALB2P22676 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALB2P22676 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALB2P22676 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALB2P22676 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CALB2P22676 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALB2P22676 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALB2P22676 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALB2P22676 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALB2P22676 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALB2P22676 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALB2P22676 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALB2P22676 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALB2P22676 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALB2P22676 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALB2P22676 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CALB2P22676 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALB2P22676 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALB2P22676 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALB2P22676 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CALB2P22676 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALB2P22676 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALB2P22676 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALB2P22676 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALB2P22676 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALB2P22676 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALB2P22676 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CALB2P22676 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CALB2P22676 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CALB2P22676 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CALB2P22676 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CALB2P22676 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CALB2P22676 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CALB2P22676 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CALB2P22676 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CALB2P22676 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALB2P22676 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALB2P22676 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALB2P22676 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALB2P22676 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALB2P22676 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALB2P22676 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALB2P22676 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALB2P22676 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALB2P22676 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms