Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
USF1P22415 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
USF1P22415 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
USF1P22415 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
USF1P22415 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
USF1P22415 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
USF1P22415 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
USF1P22415 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
USF1P22415 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
USF1P22415 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
USF1P22415 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
USF1P22415 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
USF1P22415 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
USF1P22415 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
USF1P22415 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
USF1P22415 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
USF1P22415 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF1P22415 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF1P22415 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF1P22415 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF1P22415 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF1P22415 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF1P22415 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF1P22415 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF1P22415 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF1P22415 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF1P22415 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF1P22415 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF1P22415 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF1P22415 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF1P22415 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
USF1P22415 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF1P22415 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF1P22415 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
USF1P22415 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF1P22415 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF1P22415 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
USF1P22415 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF1P22415 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF1P22415 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF1P22415 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF1P22415 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF1P22415 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF1P22415 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF1P22415 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
USF1P22415 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF1P22415 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF1P22415 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF1P22415 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF1P22415 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF1P22415 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF1P22415 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF1P22415 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF1P22415 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF1P22415 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF1P22415 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF1P22415 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF1P22415 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF1P22415 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF1P22415 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF1P22415 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
USF1P22415 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.19
USF1P22415 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
USF1P22415 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
USF1P22415 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
USF1P22415 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
USF1P22415 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
USF1P22415 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
USF1P22415 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
USF1P22415 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
USF1P22415 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
USF1P22415 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
USF1P22415 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
USF1P22415 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
USF1P22415 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
USF1P22415 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
USF1P22415 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
USF1P22415 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
USF1P22415 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
USF1P22415 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
USF1P22415 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
USF1P22415 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
USF1P22415 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
USF1P22415 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
USF1P22415 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
USF1P22415 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
USF1P22415 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
USF1P22415 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
USF1P22415 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
USF1P22415 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
USF1P22415 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
USF1P22415 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
USF1P22415 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
USF1P22415 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
USF1P22415 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
USF1P22415 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
USF1P22415 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
USF1P22415 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
USF1P22415 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
USF1P22415 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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