Protein–RNA interactions for Protein: P19075

TSPAN8, Tetraspanin-8, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN8P19075 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSPAN8P19075 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms