Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VCLP18206 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VCLP18206 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VCLP18206 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VCLP18206 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VCLP18206 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VCLP18206 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VCLP18206 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VCLP18206 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VCLP18206 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VCLP18206 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VCLP18206 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VCLP18206 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VCLP18206 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VCLP18206 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VCLP18206 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VCLP18206 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VCLP18206 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VCLP18206 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VCLP18206 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VCLP18206 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VCLP18206 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VCLP18206 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VCLP18206 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
VCLP18206 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VCLP18206 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VCLP18206 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
VCLP18206 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
VCLP18206 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VCLP18206 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VCLP18206 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VCLP18206 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VCLP18206 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VCLP18206 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VCLP18206 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VCLP18206 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VCLP18206 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VCLP18206 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VCLP18206 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VCLP18206 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VCLP18206 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VCLP18206 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VCLP18206 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VCLP18206 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VCLP18206 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
VCLP18206 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VCLP18206 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VCLP18206 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VCLP18206 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VCLP18206 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VCLP18206 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VCLP18206 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VCLP18206 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VCLP18206 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VCLP18206 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VCLP18206 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VCLP18206 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VCLP18206 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VCLP18206 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VCLP18206 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VCLP18206 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VCLP18206 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VCLP18206 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VCLP18206 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VCLP18206 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VCLP18206 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VCLP18206 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VCLP18206 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VCLP18206 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VCLP18206 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VCLP18206 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VCLP18206 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VCLP18206 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VCLP18206 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VCLP18206 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VCLP18206 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VCLP18206 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VCLP18206 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VCLP18206 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VCLP18206 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VCLP18206 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VCLP18206 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VCLP18206 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VCLP18206 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VCLP18206 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VCLP18206 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VCLP18206 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VCLP18206 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VCLP18206 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VCLP18206 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VCLP18206 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VCLP18206 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VCLP18206 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VCLP18206 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VCLP18206 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VCLP18206 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VCLP18206 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VCLP18206 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VCLP18206 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VCLP18206 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms