Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EPCAMP16422 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms