Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB1P08034 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB1P08034 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB1P08034 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB1P08034 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB1P08034 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB1P08034 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB1P08034 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB1P08034 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB1P08034 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB1P08034 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB1P08034 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB1P08034 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB1P08034 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB1P08034 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB1P08034 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB1P08034 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB1P08034 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB1P08034 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB1P08034 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB1P08034 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJB1P08034 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJB1P08034 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJB1P08034 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJB1P08034 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJB1P08034 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJB1P08034 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJB1P08034 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJB1P08034 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJB1P08034 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJB1P08034 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJB1P08034 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJB1P08034 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJB1P08034 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJB1P08034 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJB1P08034 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJB1P08034 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJB1P08034 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GJB1P08034 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJB1P08034 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJB1P08034 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJB1P08034 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GJB1P08034 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJB1P08034 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJB1P08034 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJB1P08034 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJB1P08034 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJB1P08034 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJB1P08034 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJB1P08034 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJB1P08034 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJB1P08034 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJB1P08034 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJB1P08034 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJB1P08034 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB1P08034 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB1P08034 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB1P08034 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB1P08034 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB1P08034 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB1P08034 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB1P08034 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB1P08034 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB1P08034 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB1P08034 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB1P08034 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB1P08034 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB1P08034 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB1P08034 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB1P08034 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB1P08034 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB1P08034 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB1P08034 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB1P08034 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB1P08034 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB1P08034 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB1P08034 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB1P08034 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB1P08034 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB1P08034 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB1P08034 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB1P08034 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB1P08034 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB1P08034 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB1P08034 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB1P08034 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB1P08034 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB1P08034 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB1P08034 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB1P08034 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB1P08034 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB1P08034 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB1P08034 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB1P08034 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB1P08034 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB1P08034 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB1P08034 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB1P08034 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB1P08034 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJB1P08034 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms