Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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CLDN9O95484 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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CLDN9O95484 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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CLDN9O95484 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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CLDN9O95484 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
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