Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPLO60437 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPLO60437 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPLO60437 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPLO60437 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PPLO60437 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPLO60437 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPLO60437 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPLO60437 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPLO60437 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PPLO60437 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PPLO60437 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PPLO60437 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPLO60437 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPLO60437 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPLO60437 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPLO60437 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPLO60437 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PPLO60437 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPLO60437 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPLO60437 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPLO60437 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPLO60437 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPLO60437 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPLO60437 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPLO60437 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPLO60437 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPLO60437 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPLO60437 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPLO60437 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPLO60437 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPLO60437 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPLO60437 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPLO60437 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPLO60437 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPLO60437 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPLO60437 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPLO60437 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PPLO60437 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPLO60437 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPLO60437 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPLO60437 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPLO60437 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPLO60437 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPLO60437 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPLO60437 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPLO60437 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPLO60437 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPLO60437 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPLO60437 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPLO60437 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPLO60437 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPLO60437 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPLO60437 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPLO60437 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPLO60437 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPLO60437 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPLO60437 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PPLO60437 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPLO60437 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPLO60437 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPLO60437 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPLO60437 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPLO60437 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PPLO60437 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPLO60437 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPLO60437 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPLO60437 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPLO60437 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPLO60437 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPLO60437 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPLO60437 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPLO60437 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPLO60437 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPLO60437 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPLO60437 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPLO60437 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPLO60437 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
PPLO60437 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
PPLO60437 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
PPLO60437 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPLO60437 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPLO60437 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPLO60437 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPLO60437 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPLO60437 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPLO60437 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPLO60437 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPLO60437 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPLO60437 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPLO60437 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPLO60437 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPLO60437 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPLO60437 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPLO60437 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PPLO60437 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPLO60437 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPLO60437 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPLO60437 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPLO60437 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.2 ms