Protein–RNA interactions for Protein: O43402

EMC8, ER membrane protein complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC8O43402 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC8O43402 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC8O43402 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC8O43402 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC8O43402 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC8O43402 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC8O43402 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC8O43402 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC8O43402 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC8O43402 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC8O43402 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC8O43402 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC8O43402 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC8O43402 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMC8O43402 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMC8O43402 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMC8O43402 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMC8O43402 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EMC8O43402 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMC8O43402 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMC8O43402 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMC8O43402 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMC8O43402 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMC8O43402 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMC8O43402 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMC8O43402 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMC8O43402 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMC8O43402 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMC8O43402 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMC8O43402 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMC8O43402 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMC8O43402 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EMC8O43402 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EMC8O43402 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMC8O43402 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMC8O43402 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMC8O43402 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EMC8O43402 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMC8O43402 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMC8O43402 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMC8O43402 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMC8O43402 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMC8O43402 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMC8O43402 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMC8O43402 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMC8O43402 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMC8O43402 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC8O43402 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC8O43402 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC8O43402 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC8O43402 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC8O43402 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC8O43402 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC8O43402 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC8O43402 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC8O43402 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC8O43402 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC8O43402 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC8O43402 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC8O43402 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC8O43402 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC8O43402 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC8O43402 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC8O43402 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC8O43402 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC8O43402 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC8O43402 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC8O43402 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC8O43402 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC8O43402 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC8O43402 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC8O43402 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC8O43402 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC8O43402 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC8O43402 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC8O43402 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC8O43402 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC8O43402 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC8O43402 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC8O43402 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC8O43402 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC8O43402 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC8O43402 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC8O43402 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC8O43402 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC8O43402 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC8O43402 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC8O43402 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC8O43402 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC8O43402 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC8O43402 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EMC8O43402 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EMC8O43402 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EMC8O43402 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EMC8O43402 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
EMC8O43402 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EMC8O43402 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EMC8O43402 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EMC8O43402 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EMC8O43402 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms