Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNMO15061 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNMO15061 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNMO15061 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNMO15061 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNMO15061 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNMO15061 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNMO15061 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNMO15061 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNMO15061 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNMO15061 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNMO15061 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNMO15061 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNMO15061 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNMO15061 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNMO15061 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNMO15061 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNMO15061 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNMO15061 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNMO15061 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNMO15061 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNMO15061 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNMO15061 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNMO15061 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNMO15061 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNMO15061 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNMO15061 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNMO15061 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNMO15061 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNMO15061 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNMO15061 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNMO15061 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNMO15061 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNMO15061 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNMO15061 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNMO15061 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNMO15061 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNMO15061 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNMO15061 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNMO15061 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNMO15061 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNMO15061 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNMO15061 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNMO15061 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNMO15061 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNMO15061 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNMO15061 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNMO15061 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNMO15061 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNMO15061 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNMO15061 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNMO15061 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNMO15061 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNMO15061 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNMO15061 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNMO15061 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNMO15061 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNMO15061 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNMO15061 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNMO15061 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNMO15061 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNMO15061 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNMO15061 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNMO15061 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNMO15061 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNMO15061 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNMO15061 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNMO15061 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNMO15061 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNMO15061 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNMO15061 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNMO15061 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNMO15061 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNMO15061 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNMO15061 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNMO15061 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNMO15061 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNMO15061 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNMO15061 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNMO15061 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNMO15061 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNMO15061 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNMO15061 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNMO15061 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNMO15061 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNMO15061 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNMO15061 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNMO15061 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNMO15061 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNMO15061 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNMO15061 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNMO15061 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNMO15061 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNMO15061 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNMO15061 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNMO15061 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNMO15061 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNMO15061 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNMO15061 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNMO15061 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms