Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM6BO15054 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms