Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms