Protein–RNA interactions for Protein: A2VEC9

SSPO, SCO-spondin, humanhuman

Predictions only

Length 5,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPOA2VEC9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SSPOA2VEC9 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
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