Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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SNX13Q9Y5W8 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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SNX13Q9Y5W8 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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SNX13Q9Y5W8 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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SNX13Q9Y5W8 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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SNX13Q9Y5W8 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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SNX13Q9Y5W8 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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SNX13Q9Y5W8 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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SNX13Q9Y5W8 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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SNX13Q9Y5W8 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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SNX13Q9Y5W8 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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