Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms