Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms