Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC4Q9Y296 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms