Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLEC4AQ9UMR7 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms