Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIG8

SLCO3A1, Solute carrier organic anion transporter family member 3A1, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO3A1Q9UIG8 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLCO3A1Q9UIG8 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLCO3A1Q9UIG8 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLCO3A1Q9UIG8 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SLCO3A1Q9UIG8 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLCO3A1Q9UIG8 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLCO3A1Q9UIG8 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLCO3A1Q9UIG8 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLCO3A1Q9UIG8 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLCO3A1Q9UIG8 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLCO3A1Q9UIG8 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLCO3A1Q9UIG8 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLCO3A1Q9UIG8 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLCO3A1Q9UIG8 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLCO3A1Q9UIG8 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLCO3A1Q9UIG8 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLCO3A1Q9UIG8 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLCO3A1Q9UIG8 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLCO3A1Q9UIG8 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLCO3A1Q9UIG8 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLCO3A1Q9UIG8 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLCO3A1Q9UIG8 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLCO3A1Q9UIG8 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLCO3A1Q9UIG8 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLCO3A1Q9UIG8 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLCO3A1Q9UIG8 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLCO3A1Q9UIG8 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLCO3A1Q9UIG8 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLCO3A1Q9UIG8 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLCO3A1Q9UIG8 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLCO3A1Q9UIG8 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLCO3A1Q9UIG8 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLCO3A1Q9UIG8 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLCO3A1Q9UIG8 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLCO3A1Q9UIG8 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLCO3A1Q9UIG8 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLCO3A1Q9UIG8 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLCO3A1Q9UIG8 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLCO3A1Q9UIG8 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLCO3A1Q9UIG8 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLCO3A1Q9UIG8 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLCO3A1Q9UIG8 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLCO3A1Q9UIG8 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLCO3A1Q9UIG8 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLCO3A1Q9UIG8 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLCO3A1Q9UIG8 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLCO3A1Q9UIG8 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLCO3A1Q9UIG8 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLCO3A1Q9UIG8 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLCO3A1Q9UIG8 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLCO3A1Q9UIG8 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SLCO3A1Q9UIG8 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLCO3A1Q9UIG8 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLCO3A1Q9UIG8 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLCO3A1Q9UIG8 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLCO3A1Q9UIG8 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLCO3A1Q9UIG8 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLCO3A1Q9UIG8 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLCO3A1Q9UIG8 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLCO3A1Q9UIG8 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLCO3A1Q9UIG8 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLCO3A1Q9UIG8 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLCO3A1Q9UIG8 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLCO3A1Q9UIG8 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLCO3A1Q9UIG8 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLCO3A1Q9UIG8 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLCO3A1Q9UIG8 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLCO3A1Q9UIG8 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLCO3A1Q9UIG8 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLCO3A1Q9UIG8 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLCO3A1Q9UIG8 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLCO3A1Q9UIG8 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLCO3A1Q9UIG8 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLCO3A1Q9UIG8 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLCO3A1Q9UIG8 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLCO3A1Q9UIG8 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLCO3A1Q9UIG8 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLCO3A1Q9UIG8 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLCO3A1Q9UIG8 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLCO3A1Q9UIG8 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLCO3A1Q9UIG8 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLCO3A1Q9UIG8 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLCO3A1Q9UIG8 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLCO3A1Q9UIG8 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLCO3A1Q9UIG8 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLCO3A1Q9UIG8 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLCO3A1Q9UIG8 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLCO3A1Q9UIG8 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLCO3A1Q9UIG8 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLCO3A1Q9UIG8 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLCO3A1Q9UIG8 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLCO3A1Q9UIG8 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLCO3A1Q9UIG8 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLCO3A1Q9UIG8 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLCO3A1Q9UIG8 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLCO3A1Q9UIG8 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLCO3A1Q9UIG8 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLCO3A1Q9UIG8 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLCO3A1Q9UIG8 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms