Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms