Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms