Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms