Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DKK3Q9UBP4 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms