Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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CPNE7Q9UBL6 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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CPNE7Q9UBL6 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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CPNE7Q9UBL6 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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CPNE7Q9UBL6 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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CPNE7Q9UBL6 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms