Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNMT3BQ9UBC3 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms