Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms