Protein–RNA interactions for Protein: Q9P298

HIGD1B, HIG1 domain family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1BQ9P298 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD1BQ9P298 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms